Unit Pentadbiran diketuai oleh Tuan Hj Wan Mohamad Nasir Bin Wan Abdul Rahman selaku Pengarah Politeknik Kota Kinabalu dan dibantu oleh Puan Hjh Norehan Bt Md Shariff selaku Timbalan Pengarah Akademik dan En. Samat Bin Soion @ Saion selaku Timbalan Pengarah Sokongan Akademik. Unit Pentadbiran melaksanakan semua urusan Perkhidmatan dan Perjawatan, Pentadbiran Am dan Kewangan.